太古时期，天地初分，人神共居。
女娲氏炼五色石补天後，见人间部落纷争不断，心生忧虑。她在昆仑山之巅，以补天剩馀的石头铸成三块石碑，每块石碑上都刻有天地玄机。这三块石碑，成为改变人间命运的关键。
九黎部落首领蚩尤，率先发现了这三块石碑。
蚩尤生得铜头铁额，身长八尺有馀，力大无穷，勇猛过人。他在深山狩猎时，三块石碑突然从天而降，散发着万道霞光。蚩尤跪拜三日，用心参悟。
然而石碑上的内容深奥难懂，蚩尤苦思冥想四十九天，最终只参透了其中两块。
第一块石碑，他领悟出《七刃》刀诀。此刀诀以天地之力为根基，每一式都可演化出千万种变化。蚩尤持刀演练，刀气纵横十丈，山石崩裂，古树折断。
第二块石碑，他领悟出《战经》。这是一部关於战斗运用的法则，讲究以战养战，越战越强。蚩尤将《七刃》与《战经》融合，创造出威震古今的《蚩尤战经》。
但第三块石碑，蚩尤始终无法参透。那石碑上似乎有道道光影流转，却又难以捉摸。蚩尤性情刚烈，越是无法参透，越是烦躁，最後竟举起巨斧要劈碎石碑，幸得部下拚死劝阻，才保住了石碑。
蚩尤信奉强者生存丶弱者淘汰的铁律。他率领九黎大军，所到之处尸横遍野，血流成河。不服从者杀，投降者为奴。九黎部族在他的率领下日益强大，直逼中原。
中原地区的有熊氏首领黄帝，听闻蚩尤残暴，忧心忡忡。他召集部落长老商议，众人都认为：「蚩尤凶猛，不能硬拼，只能智取。」
黄帝爱民如子，不愿生灵涂炭。他日夜祈祷上天，愿以自身承受苦难，换取天下太平。
这天夜里，女娲被其诚心感动，再次降下三块石碑。
黄帝得到石碑後，同样参悟了四十九天。他也只参透了其中两块。
第一块石碑，他领悟出《内经》。这是一部养生练气之法，讲究以静制动，以柔克刚，在胸中培养浩然正气。
第二块石碑，他领悟出《外诀》。这是一部用兵布阵之道，讲究根据敌情变化，以正兵迎敌，以奇兵取胜。
黄帝将《内经》与《外诀》结合，创造出《轩辕天书》。
然而第三块石碑，黄帝同样无法参透。那石碑上的内容似乎记录着某种天地至理，却又模糊不清。黄帝不急不躁，每日诚心参悟，将石碑供奉在军营大帐中。
两雄相争，终究无法避免。
蚩尤率领九黎大军，浩浩荡荡杀向中原。黄帝联合炎帝，组成联军，在涿鹿之野迎战。
战争初期，蚩尤凭藉《蚩尤战经》的威力，所向披靡。他的刀法凌厉无比，一刀劈出便有数人倒下。九黎战士在他的率领下奋不顾身，杀得联军节节败退。
更可怕的是，蚩尤部下有许多巫祝。这些巫祝通晓鬼神之术，能够呼风唤雨，撒豆成兵。
大战第三天，蚩尤命令巫祝布下漫天大雾。
这雾来得诡异，先是山间飘出缕缕白气，渐渐汇成浓雾。不过一个时辰，方圆百里便被大雾笼罩，伸手不见五指。
黄帝联军顿时大乱。
士兵在雾中分不清方向，有的互相碰撞，有的跌入沟壑，有的甚至朝着敌阵方向走去。蚩尤趁机率军冲杀，刀光闪过，联军人头落地。
「天要亡我！」黄帝仰天长叹。
一连三天三夜，大雾不散。联军屡战屡败，死伤无数，陷入绝境。
这天夜里，黄帝的臣子风後苦思破敌之策。他在军营中踱步，不时望向供奉在中军帐中的第三块石碑。
忽然间，石碑上光芒大盛。
风後只觉脑海中有一道光影流转，仿佛看见一辆奇特的战车——车上立着一个小木人，无论车子如何转向，小木人的手臂始终指向同一个方向。
「指南车！」风後恍然大悟。
他连夜赶制，根据石碑的启示，造出了能够辨别方向的指南车。车上设有机械结构，与木人手臂相连，无论车子如何转动，木人手臂始终指向南方。
第二天，大雾依旧弥漫。但这一次，联军有了指南车指引，不再迷失方向。
黄帝命令指南车开路，大军随後，终於冲出迷雾。蚩尤趁雾攻击的计划彻底失败。
蚩尤见大雾被破，怒不可遏。
他亲自前往北海，请来了风伯和雨师。这两人是上古凶神，能够操纵风雨。风伯一张口便能吹出狂风，飞沙走石；雨师一挥手便能降下暴雨，洪水滔天。
两军再次交战。
风伯站在九黎军阵前，张口一吹。刹那间狂风大作，飞沙走石。联军士兵被风吹得睁不开眼，站不稳脚，阵型大乱。
雨师紧随其後，挥手作法。暴雨倾盆而下，洪水从山上奔涌而来，冲入联军阵中。士兵在水中挣扎，无数人被洪水卷走。
蚩尤趁势率军冲杀，刀光所过之处血雨腥风。
黄帝联军大败，退守高地。蚩尤围而不攻，企图将联军困死。
黄帝望着山下汹涌的洪水，听着呼啸的狂风，心中悲苦。他跪在第三块石碑前诚心祈祷：「女娲娘娘，请救救这些无辜的士兵！」
这天夜里，石碑再次大放光明。
黄帝梦中见一位女子从天而降，她说：「我是天女旱魃，掌管乾旱。风伯雨师虽强，却不是我的对手。」
第二天，旱魃降临战场。
她站在高空，张开双臂。刹那间狂风停止，暴雨停歇。洪水退去，大地重现。风伯雨师见状大惊，急忙施法，却发现法术全然无效。
旱魃目光如电，望向风伯雨师。二人心胆俱裂，转身就逃。
黄帝趁机率军冲杀，大败九黎军。蚩尤率残部狼狈逃窜，退守百里之外。
蚩尤连番受挫，心中怨恨难平。
他在帐中独坐，回想自己征战一生，从未遭遇如此大败。那个黄帝不过是中原一个小小部落的首领，凭什麽能够屡次击败自己？
正在怨恨时，帐外忽然阴风阵阵。
一道黑影飘入帐中，声音阴森地响起：「蚩尤，你想报仇吗？」
蚩尤猛地抬头：「你是谁？」
「我是谁不重要，重要的是我能帮你。」黑影绕着蚩尤转了一圈，「你虽然悟出了《蚩尤战经》，但那不过是凡间武学。若想真正天下无敌，需要更强的力量。」
「什麽力量？」
「元始天魔的力量。」
黑影向蚩尤讲述了另一个境界——《蚩尤战经》中隐藏的秘密，需要引入魔气才能开启。而这个秘密，就藏在第三块石碑之中。
蚩尤恍然大悟。他连夜赶往当初发现石碑的地方，第三块石碑果然还在。这一次他不再暴躁，而是静心参悟。
七天七夜後，石碑上的光影终於化为清晰的字迹。
蚩尤看到了三个境界——
天魔骨：融合三十六道地魔煞气，配合《毁天》撕裂九天封印，获得元始天魔一口真气，方可达到。
地魔骨：引三十六道地煞入体，一煞成一魔，三十六魔融合成地魔煞体。
人魔骨：以魔气炼成魔傀虫，虫入人脑，将人炼成魔傀，不知疼痛，不畏死亡，只听从血主命令。
蚩尤大喜，当即按照石碑记载，引入魔气。
刹那间天地变色。三十六道地煞之气从地底冲出，钻入蚩尤体内。每入一道地煞，蚩尤的气息就强盛一分。他的眼睛逐渐变得血红，皮肤上浮现出诡异的纹路。
当第三十六道地煞入体时，蚩尤仰天长啸。他的身躯开始扭曲丶膨胀，最终化作一个三头六臂的魔神形象。元始天魔的一口真气从九天之上降下，注入蚩尤体内。
《蚩尤战经》彻底转化为《蚩尤魔经》。
蚩尤的军队也被转化为魔傀。
按照人魔骨的记载，蚩尤以自己的精血炼制了无数魔傀虫。这些虫子细如发丝，肉眼难以看见。蚩尤命令将这些虫子投入联军俘虏身上，虫子一入脑，俘虏们便双目血红，失去神智，成为只听从蚩尤命令的魔傀。
这些魔傀不知疼痛，不畏死亡，刀砍枪刺都毫无畏惧。即使断臂折腿，依然向前冲杀。它们没有恐惧，没有疲惫，是最可怕的战士。
魔军再次来临。
这一战，蚩尤的军队如同地狱恶鬼。魔傀们前赴後继，不知死亡为何物。联军士兵奋力厮杀，砍倒一个，又冲上来十个。那些魔傀即使被砍成重伤，依然爬行向前，张口撕咬。
联军胆寒。
更可怕的是蚩尤本人。他三头六臂，手持各种兵器，冲入联军阵中如入无人之境。六臂齐挥，周围的士兵成片倒下。他的六只眼睛血红发光，所过之处联军士兵心胆俱裂。
黄帝眼看联军节节败退，心急如焚。他再次跪在第三块石碑前祈祷。
石碑上光芒流转，这一次黄帝终於看清了上面的内容——
取东海神兽夔的皮，制成战鼓；取雷泽中雷兽的骨，制成鼓槌。鼓声响处，可破魔气。
黄帝当即命令前往东海。
那夔是东海中的神兽，形似牛而无角，只有一只脚。它出入水中必有风雨相随，身上散发着日月般的光芒。黄帝的使者找到夔时，它正在海中嬉戏，掀起滔天巨浪。
使者依照石碑记载，用神弓射杀夔兽，剥下它的皮，制成一面巨大的战鼓。
接着又前往雷泽。那雷泽中有一种雷兽，形似龙而无角，喜欢用尾巴拍打腹部，每拍一次便发出一声惊雷。使者找到雷兽，取来它的骨骼，制成鼓槌。
战鼓送到军前时，蚩尤正率军发动总攻。
黄帝亲自擂鼓。
第一声鼓响，声震五百里。联军士兵只觉一股热流涌遍全身，疲惫尽消，士气大振。他们的眼睛变得明亮，手中的兵器更加有力。
第二声鼓响，魔傀们纷纷抱头惨叫。体内的魔气被鼓声震得溃散，魔傀虫在它们脑中挣扎死去。无数魔傀倒地不起，恢复了普通尸体的模样。
第三声鼓响，蚩尤身躯一震。他体内的魔气开始紊乱，三十六道地煞仿佛要挣脱出去。他三头六臂的形象开始扭曲，六只眼睛中的血光逐渐黯淡。
黄帝趁机指挥全军总攻。
联军士兵如猛虎下山，冲入魔军阵中。没有了魔傀的九黎军，不过是普通士兵。他们在联军的攻势下节节败退，死伤无数。
蚩尤见大势已去，想要逃窜。
但他体内魔气紊乱，行动迟缓。黄帝率军紧紧追赶，不给他喘息之机。
追到涿鹿之野的一处山谷时，黄帝忽然想起第三块石碑上的最後一段记载——封魔大阵。
这是一座专门封印魔气的阵法，需要八八六十四名修为高深的将士，按照八卦方位站立，同时运功。阵法完成时，会形成一座无形的封印结界，将魔气彻底封锁。
黄帝当即传令，挑选六十四名精锐将士，按照石碑记载布阵。
蚩尤被引入山谷中时，六十四名将士已经各就各位。黄帝一声令下，众人同时运功。
刹那间山谷中光芒大盛。六十四道光芒从将士们身上发出，交织成一座巨大的八卦图案，从天而降，将蚩尤罩在其中。
蚩尤大惊，拚命挣扎。他体内的魔气疯狂涌出，想要冲破封印。但每一次冲击，都被八卦图案上的光芒弹回。
三十六道地煞一道接一道地从蚩尤体内被逼出，每逼出一道地煞，蚩尤的气息就衰弱一分。他的三头六臂逐渐消失，恢复了本来面目。
当最後一道地煞离体时，蚩尤瘫倒在地，再也无力反抗。
黄帝走上前去。
蚩尤抬起头，眼中满是怨恨：「你……你赢了。」
黄帝叹息一声：「蚩尤，你本是一代战神，可惜误入魔道。你若肯投降，我可饶你一命。」
蚩尤惨然一笑：「强者生，弱者死。今天我败了，无话可说。但要我投降，绝无可能。」
他猛然挣扎起身，扑向黄帝。旁边的将士们急忙拦截，乱刀齐下。
蚩尤倒在血泊之中。
黄帝命令厚葬蚩尤，并将《蚩尤魔经》的三部分分别封印。天魔骨的修炼之法被毁去，地魔骨和人魔骨的修炼之法被神秘封存。
涿鹿之战後，黄帝统一天下。